Gerade unter Linux sind noch einige Dinge zu konfigurieren, bevor der AVRISP MKII auch gut  läuft. Da AVRDUDE fast von jeder IDE wie z.b. von platform.io genutzt wird, ist dies auch für andere Entwicklungsumgebungen hilfreich.
Als erstes wird eine Datei erstellt  /etc/udev/avrisp.rules
mit dem Inhalt
SUBSYSTEM!="usb", ACTION!="add", GOTO="avrisp_end"
# Atmel Corp. JTAG ICE mkII
ATTR{idVendor}=="03eb", ATTR{idProduct}=="2103", MODE="660", GROUP="dialout"
# Atmel Corp. AVRISP mkII
ATTR{idVendor}=="03eb", ATTR{idProduct}=="2104", MODE="660", GROUP="dialout"
# Atmel Corp. Dragon
ATTR{idVendor}=="03eb", ATTR{idProduct}=="2107", MODE="660", GROUP="dialout"
LABEL="avrisp_end"
Nun wird noch ein symlink angelegt
cd /etc/udev/rules.d
sudo ln ../avrisp.rules 60-avrisp.rules

..noch prüfen, ob man auch in der dialout Gruppe ist.
groups
udev neu starten…
sudo service udev restart
USB Device einmal reconnecten und dann sollte alles funktionieren.